Изкореняването на корени е задача, която често изглежда по-сложна, отколкото самото отсичане на дървото. Докато стволът и клоните могат сравнително лесно да бъдат премахнати, корените остават дълбоко в земята и с времето започват да създават проблеми. Те могат да пречат на изграждането на настилки, основи, алеи или да не позволяват засаждането на нови растения. Затова премахването им е важна стъпка при подготовката на всеки терен.

Най-разпространеният начин е механичното изкореняване. То може да се извърши ръчно – с кирка, лопата и много физическа сила – но този подход е подходящ предимно за по-малки дървета и храсти. При по-големи пънове и дълбоки коренови системи се използва специализирана техника като багери, кранове или машини за раздробяване на пънове. Това позволява работата да се извърши бързо, чисто и без да се разкопава прекалено голяма площ.

Друг вариант е химическото третиране на корените. В пъна се пробиват отвори, които се запълват със специални препарати, ускоряващи разграждането на дървесината. С течение на времето корените омекват и започват да се разпадат, което значително улеснява тяхното премахване. Макар този метод да е по-бавен, той е удобен в случаи, когато няма възможност за използване на тежка техника или когато изкореняването не е спешно.

Съществува и метод, при който корените се изгарят. Това обикновено става след предварително пробиване и третиране, а след време дървесината се подпалва и постепенно изгаря. Макар ефективен, този подход крие рискове, затова трябва да се прилага внимателно и само на места, където няма опасност от пожар.

Който и метод да се избере, най-важното е да се подходи с внимание към терена и околната среда. Ако корените се намират в близост до сгради, тръби или електрически инсталации, ръчното или машинното изкореняване трябва да се извърши от професионалисти, за да се избегнат щети. Така ще се спестят време, усилия и излишни разходи, а теренът ще бъде подготвен за следващия етап – независимо дали става дума за строителство, озеленяване или ново засаждане.